一、細菌培養
在臨床實踐中，對社區獲得性肺炎患者通過應用常規的檢測方法來確定病原菌仍存在許多障礙。從血液或胸腔積液培養分離獲得SP仍然作為診斷的金標準，但它的陽性率僅10%～30%，甚至更低。SP可定植于健康人群的鼻咽部及不充足或不恰當的痰標本使得基于痰培養的診斷標準飽受爭議。
此外，近1/3的患者進行病原學檢測前已接受了抗生素治療，這又降低了這種傳統的檢測手段的敏感性。若通過一些創傷性操作所獲得的標本（如支氣管灌洗液、肺穿刺獲得的肺組織等）培養分離得到SP，則對病原學的診斷具有決定性意義。
但是，由于創傷性技術需要專業人員進行操作并且有發生并發癥的可能，因此不作為常規檢查。雖然細菌培養所需要等待的時間較長（一般3～5 d），可能出現假陰性的結果（后者與標本量過少、已接受抗生素治療或不理想的實驗室條件均有關），但由于它是進行藥敏試驗及對流行株進行流行病學分析的基礎，因此該技術在臨床上仍有不可取代的地位。
二、免疫層析法
免疫層析法（ICT）是目前廣泛用于SP診斷的快速方法。其檢測的抗原為Cpolysaccharide抗原，是位于細菌細胞壁的C多糖，為SP各血清型所共有。由于ICT以尿樣為檢測對象，故又稱為尿抗原檢測法。
目前世界各國采用的是美國緬因州波特蘭Binax公司生產的Binax NOW ICT試劑盒。這是個非常簡便的方法，只需15 min便可完成。該方法推薦使用的標本為標準的非濃縮尿樣。將拭子條浸入尿樣后置于檢測卡中，再加入6滴試劑，15 min后出現1條色帶的為陰性，2條色帶的為陽性結果。該試劑盒在臨床診斷中具有較好的敏感性和特異性。
據現有的報道敏感性為67%～92%（大多為75%～85%），特異性為90%～100%。該試劑盒同樣可用于檢測胸腔積液、腦脊液和支氣管灌洗液。2002～2006年，西班牙的Jose M. Porcel等人采用該試劑盒對患者的胸水進行檢測，發現敏感性為70.6%，特異性為93.3%。該方法較突出的優點是抗生素的使用并不影響檢測結果的準確性，因此它不能用于評價抗生素治療效果。在感染后1月內該試驗均可陽性，這也造成了那些反復感染的病例被誤診的潛在可能性。特別在兒童中，由于SP的定植造成該試驗非特異性陽性的問題已逐漸引起了關注。盡管該試驗在SP感染的兒童中敏感性較高，但在尿抗原檢測呈陽性的病例中仍有7%～15%的病例沒有SP感染的臨床證據。
ICT雖然在SP鼻咽攜帶者中存在假陽性結果，但由于ICT標本采集簡便，不具創傷性，不受先前抗生素治療干擾，具有較高的敏感性和特異性，15 min便可完成檢測等優點，是快速診斷SP感染的簡便方法。
三、聚合酶鏈式反應
聚合酶鏈式反應（PCR）敏感性高，特異性強，實時熒光定量PCR可對擴增產物進行可重復定量檢測，在擴增的每個循環中至少收集一次熒光數據，對擴增產物進行實時監控，從而增加PCR的敏感性和特異性。2001～2004年，Alban Le Monnier等對社區獲得性肺炎患者的胸腔積液進行SP16S rDNA基因檢測，發現該試驗的敏感性為77%。在抗生素治療初期，PCR不受其干擾，因此為早期診斷提供了較可靠的依據。然而，與ICT相比，PCR是一種復雜、耗時的檢測方法，還未完全標準化，從而妨礙其成為SP臨床診斷方法，主要作為實驗研究的技術方法。
